政府16日召开防疫战略会议，讨论了防疫通行证调整案，最终决定在全国商店、超市、百货商店解除防疫通行证的适用。考虑到防疫通行给国民带来的不便和防疫状况多少有些稳定、戴口罩传播的危险性较低等因素，最终得出了撤回防疫通行证的结论。
此前的14日，首尔行政法院做出了部分停止超市、百货商店防疫通行效力申请的判断。因此，在首尔停止实施防疫通行认证的同时，在确诊患者相对较少的非首都圈却维持着防疫通行认证，16日全国各地超市、百货商店就防疫通行证适用问题，市民们经历了很大的混乱。尽管法院判决，但首尔部分超市、百货商店仍然要求确认防疫通行认证，与顾客发生了摩擦，地方上追究“公平性问题”的顾客层出不穷。
京畿道居民安某（52岁）表示不满说:“不知道是不是应该离开京畿道去首尔的超市买菜”，“给市民的日常生活带来如此不便的做法太过分了”。上班族权某（37岁）指出:“新型冠状病毒已经发生2年多，生活变得更加不便”。
专家们认为，超市、百货商店的防疫通行费实际收益并不大。高丽大学九老医院感染内科教授金宇柱指出:“感觉过度使用了防疫认证”。这是首尔行政法院行政4部14日在首尔市停止防疫通行效力后得出的结果。随着超市等防疫通行认证效力停止的决定被限制在首尔内的设施，有人提出除首尔市外，个别地方自治团体有可能继续提出取消防疫通行认证及停止执行诉讼。原告方面表示:“首先，正在讨论对原告代表赵斗亨教授的根据地大邱广域市进行相同宗旨的诉讼”。
政府担心,如果各地区、设施的防疫通行认证适用范围发生变化，整个防疫政策的信赖度就会下降。保健福祉部发言人孙永来（音）表示“现在流行情况比去年12月更加稳定，所以正在讨论先解除低危险设施的方案”，“此次法院的决定使政府内部的（缓和时间）讨论变得模糊不清”。据分析，地方超市和百货商店也暗示了撤回防疫通行证的可能性。
大选在即，对防疫通行证强制性的指责的舆论沸腾后，执政党似乎也期待以法院判决为契机来采取缓和措施。
共同民主党新型冠状病毒紧急对策本部所属的一位议员表示:“尊重14日法院的判决，防疫通行认证应具备各地区公平性和一贯性的原则”。
也就是说，对首尔内的商店、超市、百货商店采取停止防疫措施是值得提倡的。政府计划于17日通过中央灾难安全对策本部会议正式表明方针。
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